Rodando Imagej ou Fiji na linha de comando (ubuntu)

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Olá leitor.

Vou mostar como rodar o software Imagej ou Fiji (mesmo, mas mais completo que o ImageJ) na linha de comando (no ubuntu linux):

Antes de mais nada vou alertando que abrir o Imagej (ou Fiji) desta forma, os plugins não aparecem..

Vamos imaginar que você baixou o Imagej ou Fiji numa determinada pasta (no caso a seguir é o Fiji).
Num terminal, vá até a pasta:
fiji-linux64/Fiji.app/jars

\$ java -jar ij-1.51d.jar &

O sinal & é apenas para desocupar o terminal.

Pode ocorrer de o nome "ij-1.51d.jar" mudar com as mudanças de versão do Imagej ou Fiji.


Desta forma você poderá executar o Imagej ou Fiji no terminal, chamar alguma função dele e automatizar alguma tarefa.

Dica:

Use as teclas "ctrl" e "f" (acionadas simultâneamente) para buscar palavras-chave dentro deste site.

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